最近PubMed推送的一篇文章，正正好是我大二刚进实验室想要做的东西，当时苦于自身能力和知识的不足，就没有实践出结果。但着却一直是我在思考的问题，应该也会是我的终极目标之一——对细胞周期的调控过程进行动力学建模。

写这个脚本的起因是最近发现了一个用Rust编写的、很神奇的文字排版工具叫做Typst，在调整排版格式的时候用PDF文件很难做到完全还原，于是需要将其灵活地转换为图片，但是每次在pdf编辑器中点又很麻烦，于是写了一个脚本，每次调整、编译时自动执行该代码即可得到编译好的pdf和对应的图片

最近在调研转录组和亚细胞结构的关系，找到了庄小威老师在2015年的一篇Science文章，其使用汉明编码，通过多轮荧光标记拍摄来定位RNA在亚细胞结构中的位置（ultiplexed errorrobust FISH，MERFISH），十分有趣。这里简单探究了下汉明码的编码和作用。

实验原理

荧光流式细胞术是根据荧光信号分离单细胞的技术，其识别的荧光可以是活细胞内表达的，也可以是固定细胞上体外标记的。因为在细胞分裂过程中遗传物种会翻倍，可以使用DNA染料染色固定细胞的方法观察细胞周期。其通常使用乙醇固定、PI染色（有可以使用DAPI）后即可上机流式细胞仪，得到.fcs文件。

无论流式筛选还是流式检测，其实验成功最最关键的点是对荧光信号的准确识别，需要通过多个通道的信号参数，成功过滤掉细胞碎片、粘连体细胞以及阴性细胞。需要注意的是，这一数据分析过程是在上机时需要即刻判断的。

最近上头了一个尘歌壶套装，但是前期统计材料需求、收集材料是很痛苦的过程，如果计算出错就需要来回捯饬，很是费时间。于是乎就想要收集一个全素材的材料表，找到找去还是从米游社官方去爬数据最简单。大概思路是登陆之后，在浏览器控制台找到对数据的请求链接，然后用Python请求到数据，用BeautifulSoup解析html，用json模块解析数据，用pandas整理数据并输出。下面是一些抓数据的代码：

本文档参照Hodoku官方的教程和我的系统性梳理

对于Venn图，一直没有找到好看的Python工具，因而我一直在使用网页工具来完成：